Présentation
AlphaGenome 2 est un modèle de séquences d’ADN développé par Google DeepMind pour prédire comment les séquences et les variants génétiques influencent l’activité moléculaire dans des types et états cellulaires précis. Il a été annoncé le 11 novembre 2026. (deepmind.google)
Capacités
- Le modèle reçoit une séquence d’ADN d’environ un million de lettres et une condition biologique correspondant à un tissu, un type cellulaire ou un état cellulaire. Il prédit les effets pour une condition à la fois.
- Il prédit notamment l’expression des gènes, les modifications des histones, l’accessibilité de la chromatine et la méthylation de l’ADN. Il peut aussi estimer certaines mesures expérimentales manquantes à partir d’autres modalités.
- Il peut s’adapter à de nouveaux états cellulaires sans réentraînement à partir de données d’expression unicellulaire fournies par les chercheurs, y compris des données provenant de quelques dizaines de cellules.
- Son entraînement a utilisé des données humaines et murines, notamment plus de 107 millions de profils cellulaires individuels couvrant 68 tissus. (deepmind.google)
Utilisations et résultats
Le modèle aide à sélectionner des variants candidats, à relier des régions régulatrices à leurs gènes cibles et à étudier les types cellulaires impliqués dans les maladies. Google indique avoir précalculé des prédictions pour des variants associés à des caractères dans des centaines de conditions cellulaires et tissulaires humaines.
Sur le jeu de données TenK10K, Google rapporte l’identification de 30 % des variants causaux, contre 16 % pour les modèles de comparaison, ainsi que de 43 % des effets directionnels sur les gènes, contre 23 %. Ces résultats concernent ce test précis et ne garantissent pas une performance identique dans tous les contextes. (deepmind.google)
Disponibilité et limites
À l’annonce, AlphaGenome 2 était disponible via l’API AlphaGenome pour la recherche non commerciale et en préversion privée pour la recherche commerciale. Il est destiné uniquement à la recherche et n’a pas été validé ni approuvé pour un usage clinique ou diagnostique. Ses prédictions doivent être interprétées et vérifiées dans le cadre de la recherche. (deepmind.google)
Prix
Devise et tarifs de facturation des entrées et des sorties : non vérifiés. L’annonce officielle consultée ne précise pas ces tarifs pour AlphaGenome 2.